여주농업경영전문학교는 경기도 여주시 하동 4번지에 위치하고 있다. 정부의 ‘농어촌 발전 종합대책’ 5개년계획 추진의 일환으로 농업고등학교 3년과정에 심화과정 2년을 더하는 기본체제하에 전문 농업경영기술의 체계적인 발전과 첨단과학영농으로 농업구조 개선을 선도할 영농 후계자를 양성하는 데에 그 설립 목적을 두고 1996년 1월 3일 산업교육진흥법에 의거 여주자영농고 특별 과정(2년)을 설치함으로써 그 첫걸음을 내딛었다.

여주농업경영전문학교는 환경자원공학과 자연친화적 농업산업이 21세기 중심 사업이 되어 한국 경제의 중추적 역할을 할 것이라는 신념으로 농업 기반을 갖추고, 영농 의지가 투철한 젊은이에게 전문적 경영기술과 실무능력을 키울 수 있는 기회를 제공하고 작목(作木) 중심의 워크숍 활동과 교육 과정의 탄력적인 운영으로 학점의 개방화를 추구하고 있다. 또한 1996년 설립 이래 실습장 중심의 체험학습을 강화하고, 한국 농업 전문경영인 육성을 위한 제도적 기반 확충과 과학영농의 정보화·전산화에 총력을 기울이고 있다.